Après la mort du professeur Charles Xavier, le manoir des X-Men sera maintenant diriger par Wolverine et ses alliers. Mais la belle vie des X-Men ne sera pas ce qu`il pense puisque la Confrérie est toujours présente. La Confrérie n'aiment pas les humains et veulent se débarasser de ces derniers étant donné qu'ils craignent que les humains trouvent un moyen d'enlever le pouvoir des mutants. La rivalité entre les X-Men et la confrérie sera présente lors de toute cette histoire.